DNA的甲基化是指CpG序列的胞嘧啶转变为5'甲基胞嘧啶，这种修饰并未改变基因序列，但使基因表达水平改变，目前甲基化分析主要基于3种方法：PCR技术，限制性内切酶与重亚硫酸盐修饰法。

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染色质免疫共沉淀技术也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质和DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究.

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